Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COG3Q96JB2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms