Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGF29Q96ES7 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGF29Q96ES7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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