Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHFRQ96EP1 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms