Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms