Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP13Q92995 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP13Q92995 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP13Q92995 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP13Q92995 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP13Q92995 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.9 ms