Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERVK_113Q902F9 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113Q902F9 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms