Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms