Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms