Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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