Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
LINC00612Q8N6U2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms