Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CACNA2D4Q7Z3S7 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 868.6 ms