Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FRMPD1Q5SYB0 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRMPD1Q5SYB0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms