Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ODF2Q5BJF6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms