Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SFT2D3Q587I9 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SFT2D3Q587I9 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SFT2D3Q587I9 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SFT2D3Q587I9 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SFT2D3Q587I9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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