Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
KLHL12Q53G59 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms