Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GREB1Q4ZG55 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms