Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC96Q2M329 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms