Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PTPRNQ16849 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRNQ16849 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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