Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RTN1Q16799 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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