Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms