Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IHHQ14623 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IHHQ14623 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms