Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCARF1Q14162 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
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SCARF1Q14162 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARF1Q14162 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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