Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms