Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms