Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HDAC1Q13547 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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