Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IKZF1Q13422 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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IKZF1Q13422 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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IKZF1Q13422 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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IKZF1Q13422 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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IKZF1Q13422 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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IKZF1Q13422 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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IKZF1Q13422 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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IKZF1Q13422 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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IKZF1Q13422 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IKZF1Q13422 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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