Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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SCGB2A2Q13296 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SCGB2A2Q13296 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SCGB2A2Q13296 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SCGB2A2Q13296 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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