Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SRSF6Q13247 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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