Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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CALCOCO2Q13137 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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CALCOCO2Q13137 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO2Q13137 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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