Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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GPS1Q13098 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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GPS1Q13098 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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GPS1Q13098 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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GPS1Q13098 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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GPS1Q13098 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GPS1Q13098 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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