Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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TRAF1Q13077 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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TRAF1Q13077 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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TRAF1Q13077 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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TRAF1Q13077 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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TRAF1Q13077 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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