Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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