Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC173Q0VFZ6 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms