Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PPP3CAQ08209 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms