Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SRSF4Q08170 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms