Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN11Q06124 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN11Q06124 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms