Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLOD1Q02809 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms