Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMF1P82094 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMF1P82094 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMF1P82094 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms