Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FAM3BP58499 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms