Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP107P57740 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP107P57740 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP107P57740 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP107P57740 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP107P57740 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP107P57740 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP107P57740 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP107P57740 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP107P57740 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NUP107P57740 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NUP107P57740 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NUP107P57740 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NUP107P57740 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NUP107P57740 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NUP107P57740 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
NUP107P57740 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
NUP107P57740 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
NUP107P57740 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NUP107P57740 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NUP107P57740 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NUP107P57740 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NUP107P57740 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NUP107P57740 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NUP107P57740 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP107P57740 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP107P57740 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP107P57740 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP107P57740 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP107P57740 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP107P57740 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP107P57740 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP107P57740 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP107P57740 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP107P57740 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP107P57740 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP107P57740 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP107P57740 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP107P57740 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP107P57740 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP107P57740 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP107P57740 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP107P57740 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP107P57740 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NUP107P57740 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms