Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL23P55773 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL23P55773 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL23P55773 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL23P55773 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL23P55773 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL23P55773 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL23P55773 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL23P55773 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL23P55773 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL23P55773 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL23P55773 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL23P55773 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL23P55773 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL23P55773 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL23P55773 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL23P55773 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL23P55773 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL23P55773 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms