Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HK3P52790 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HK3P52790 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HK3P52790 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms