Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2A2P52657 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms