Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TAF6P49848 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TAF6P49848 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TAF6P49848 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms