Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NESP48681 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NESP48681 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NESP48681 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NESP48681 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NESP48681 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NESP48681 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NESP48681 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NESP48681 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NESP48681 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NESP48681 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NESP48681 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NESP48681 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NESP48681 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NESP48681 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NESP48681 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NESP48681 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NESP48681 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NESP48681 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NESP48681 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NESP48681 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NESP48681 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NESP48681 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NESP48681 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NESP48681 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NESP48681 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NESP48681 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NESP48681 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NESP48681 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NESP48681 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NESP48681 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NESP48681 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NESP48681 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NESP48681 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NESP48681 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NESP48681 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms