Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RANGAP1P46060 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RANGAP1P46060 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms