Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMPOP42166 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMPOP42166 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMPOP42166 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMPOP42166 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms