Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTNNA1P35221 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms