Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL9P32969 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL9P32969 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL9P32969 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL9P32969 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL9P32969 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL9P32969 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL9P32969 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL9P32969 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL9P32969 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL9P32969 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL9P32969 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms