Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KDELR1P24390 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms